據(jù)調(diào)查，全區(qū)有鳥類258 種，其中屬國家一級保護(hù)動(dòng)物的有9種，屬國家二級保護(hù)動(dòng)物的有32種， 是世界上最大的白鶴越冬地，全球約95%的白鶴在此越冬， 也是迄今發(fā)現(xiàn)的世界上最大的越冬鴻雁群體所在地。該保護(hù)區(qū)已逐步成為世界保護(hù)、研究鳥類的重要基地。
鄱陽湖上承贛、撫、信、饒、修五河之水，下接我國第一大河——長江。在正常的水位情況下，鄱陽湖面積有3914平方公里，容積達(dá)300億立方米。它每年流入長江的水量超過黃、淮、海三河水量的總和。鄱陽湖在九江的水面約20萬公頃，流域有都昌、湖口、廬山、永修、德安、濂溪等六個(gè)縣市（區(qū)），它是贛北的一顆明珠。
鄱陽湖在古代有過彭澤、彭湖、官亭湖等多種稱謂，在漫長的歷史年代有一個(gè)從無到有，從小到大的演變過程。遠(yuǎn)在地質(zhì)史“元古代”時(shí)期，湖區(qū)為“揚(yáng)子海槽”的一部分，大約在距今八九億年前的燕山運(yùn)動(dòng)時(shí)期，湖區(qū)地殼又經(jīng)斷陷構(gòu)成鄱陽湖盆地雛形。傳說中的黃帝時(shí)期，“彭蠢澤”向南擴(kuò)展，湖水進(jìn)抵今鄱陽湖。在彭蠢澤大舉南侵之前，低洼的鄱陽盆地上原本是人煙稠密的城鎮(zhèn)，隨著湖水的不斷南侵，鄱陽湖盆地內(nèi)的鄱陽縣城和?；杩h治先后被淹入湖中，而位于?；杩h鄰近較高處的吳城卻日趨繁榮成江西四大古鎮(zhèn)之一，因此，歷史上曾有“淹了海昏縣，出了吳城鎮(zhèn)”之說。
煙波浩渺、水域遼闊的鄱陽湖，經(jīng)過漫長的地質(zhì)演變，形成南寬北狹的形狀，猶如一只巨大的寶葫蘆系在萬里長江的腰帶上。由于帶有大量水蒸氣的東南季風(fēng)的影響，鄱陽湖年降雨量在 1000 毫米以上，從而形成“澤國芳草碧，梅黃煙雨中”的濕潤季風(fēng)型氣候，并成為著名的魚米之鄉(xiāng)。
鄱陽湖流域自古以來是我國經(jīng)濟(jì)較為發(fā)達(dá)的富裕地區(qū)，我國歷史上很多杰出人物如徐稚、陶淵明、林士弘、劉恕、洪適、江萬里、朱耷等都在湖區(qū)出生和成長。這里又發(fā)生過許多威武雄壯的英雄事跡，如周瑜操練水師、朱元璋與陳友諒鄱陽湖水戰(zhàn)、太平軍“湖口大捷”、李烈鈞在湖口發(fā)起“二次革命”等。鄱陽湖是古代從北方進(jìn)入江西的唯一水道，發(fā)生在鄱陽湖上的文人軼事和民間傳說則更是難以勝數(shù)。唐代詩人王勃在《滕王閣序》中的名句：“漁舟唱晚，響窮彭蠡之濱”，描述的正是鄱陽湖上的漁民捕魚歸來的歡樂情景。宋代詩人蘇軾在《李思訓(xùn)畫長江絕島圖》詩中時(shí)寫的“山蒼蒼，水茫茫，大姑小姑江中央”，描寫的是鄱陽湖的勝景。
鄱陽湖是我國最大的淡水湖，水位最高時(shí)湖泊約170公里長，最寬處為74公里。形狀像一個(gè)大葫蘆，倒掛在長江南岸。由贛江、撫河、饒河、信江、修河五條主要河流分別從西、南、東南三面供水，然后注入長江?？菟竟?jié)，水落灘出，各種形狀的湖泊星羅棋布，草地、濕地碧綠一片。1980年建立鄱陽湖自然保護(hù)區(qū)，面積為35000公頃，1988年建立鄱陽湖候鳥國家級自然保護(hù)區(qū)，面積為22400公頃。
鄱陽湖每年洪水期、枯水期水位變化很大，10月～翌年3月水落灘出，魚、蝦、螺、蚌及各種水草豐富，是候鳥越冬棲息的樂園。約有鳥類148種，其中水禽69種，屬國家保護(hù)的鳥類有20種，主要有白鶴、白頭鶴、黑鸛、大鴇、鵜鶘、白琵鷺等瀕危物種。建立保護(hù)區(qū)以來，開展鳥類環(huán)志，生態(tài)觀察、飼養(yǎng)馴化等研究工作，保護(hù)管理珍貴鳥類，各種候鳥的數(shù)量顯著增加。每年冬春季，成群候鳥飛翔，壯麗奇觀，受到國際鶴類基金會(huì)等國際組織的重視。
鄱陽湖的植被在湖泊中主要水生植物為苦草、眼子菜、綠藻、藍(lán)綠藻，僅有小面積的蘆葦。附近山地丘陵植被是以苦櫧、絲栗栲、鉤栲、甜櫧、青岡櫟、木菏等為主的常綠闊葉林天然次生林，此外還有杉、竹混交林；杉、馬尾松及闊葉樹混交林；常綠與落葉闊葉混交林和落葉闊葉林等。人工林大多為杉、馬尾松及其他經(jīng)濟(jì)林樹種。
保護(hù)區(qū)內(nèi)有9個(gè)淡水湖泊及周圍沼澤地和濕草地。湖水面積在4-9月的豐水季節(jié)為46466公頃，而枯水季節(jié)僅為5000公頃。保護(hù)區(qū)內(nèi)的低丘岡地海拔為37米，有一些森林、農(nóng)田和沙山等。保護(hù)區(qū)外除湖泊外，還有山地丘陵，西北部起伏較大，東部及東北部地形較為平緩，南部則多為坦蕩的農(nóng)田及低丘崗地。
保護(hù)區(qū)位于湖的西北面，基本處于海拔11－12米之間，地勢平坦，西半部受修河水影響，東部受贛江水影響(圖4)，這兩河在吳城鎮(zhèn)相匯。吳城是由沉積巖構(gòu)成的平緩的“小島”，最高處獅子山高39.6米，地層斷裂和河水侵蝕共同作用形成了吳城現(xiàn)有的地貌。
鄱陽湖屬亞熱帶濕潤性季風(fēng)型氣候，夏季炎熱潮濕，冬季干燥寒冷，冬季甚少出現(xiàn)霜凍。1983－1985年永修縣錄得最低溫度為-4.9℃(1985年12月)，夏季氣溫高達(dá)30℃以上，水溫近似于氣溫。
降水全年都有，最大的降水量在4?月，但降水分布每年區(qū)別很大，年總降水量約為1700毫米。相對濕度頗為穩(wěn)定，全年平均相對濕度為80%。
鄱陽湖為多強(qiáng)風(fēng)地區(qū)，特別是湖的北面，由長江經(jīng)湖口狹窄通道進(jìn)入鄱陽湖，對風(fēng)有加速作用。永修縣月平均風(fēng)速為2.4－2.8米/秒。尚缺乏風(fēng)向方面的數(shù)據(jù)，一般來說，冬季多北風(fēng)，夏季多南風(fēng)。冬季下雪不多，雪量僅3－7毫米。
“鄱陽湖盆”的形成可追溯到地質(zhì)史上300萬年以前，當(dāng)時(shí)發(fā)生了三組大的地層斷裂共同作用形成了“鄱陽湖盆”。在距今約18000年以前最后一次冰川期，估計(jì)當(dāng)時(shí)海平面比之前低120－130米，當(dāng)時(shí)的長江底床比之前陡峭，在九江下游形成一個(gè)約40米的深漕，使得“鄱陽湖”水很迅速地進(jìn)入長江，不能在“鄱陽湖盆”形成湖泊。冰期過后，氣溫逐漸變暖，海平而慢慢上升有現(xiàn)有的水平。由于海水的頂托作用，長江河床的溯流侵蝕作用停止，使得長江和“鄱陽湖盆”的高差因淤積而逐漸減少，從公元5世紀(jì)開始，鄱陽湖因河水潴留逐漸形成，到18世紀(jì)鄱陽湖達(dá)有的規(guī)模。
鄱陽湖可籠統(tǒng)地稱之為“吞吐型”湖泊，或者說是“過水型”湖泊，積水面積達(dá)16.22平方公里，占江西省全部面積的9.72%。一般來說，從2月到6月，進(jìn)湖水量大于出湖水量，從7月達(dá)翌年1月，出湖水量大于進(jìn)湖水量，出湖量取決于五條河(贛江、修河、信江、撫河和饒河)和長江的水位差，最大出湖量為28800立方米/秒，最小的出湖量可以是負(fù)數(shù)，即長江倒灌，達(dá)9450立方米/秒，鄱陽湖平均每年出湖量是1347億立方米。在水位為21.69米時(shí)，鄱陽湖的水而積達(dá)3210.22平方公里，蓄水量達(dá)251.7億立方米。當(dāng)水位只有9米時(shí)，水而僅216.62平方公里，蓄水量僅4.6億立方米。鄱陽湖平均每10天更新一次湖水。
鄱陽湖南北長170公里，平均寬度16.9公里(最大寬度70公里)。湖岸線1200公里，隨著自然季節(jié)性的水位下降形成330000公頃濕地，其中保護(hù)區(qū)占22400公頃，鄱陽湖的泥沙淤積主要來自五大河流，每年帶進(jìn)湖中的泥沙量達(dá)2104000噸，其中半數(shù)流入長江，剩余部分沉積在鄱陽湖，使湖床每年升高1.7毫米。
大量的圍湖造田，使湖的容量減少，造成了鄱陽湖調(diào)節(jié)洪水能力下降，加劇了洪澇災(zāi)害。因此，湖堤不得不越修越高。長江流域其它湖泊也出現(xiàn)類似情況，使得長江水位上升。過去的40年中，由于圍墾，與長江相連的湖區(qū)而積由20000平方公里萎縮到7000平方公里(鄱陽湖和洞庭湖是僅存的兩個(gè)沒有受人工控制的湖泊)，1954年長江曾發(fā)生歷史上最大洪水(水位達(dá)21.69米)。如果再發(fā)生這樣大的洪水，由于鄱陽湖調(diào)節(jié)能力的降低，水位將比1954年增高2米。
鄱陽湖在控制長江洪水中有著重要的調(diào)蓄作用。通常情況下，雨季由東向西通過中國南部，因此，五河水流高蜂出現(xiàn) 在長江高峰到來之前，這樣，在長江水倒灌進(jìn)鄱陽湖之前五河的洪水已流出了鄱陽湖。
鄱陽湖一般水質(zhì)優(yōu)良，局部地區(qū)的污染主要是有機(jī)廢物、重金屬(銅、鋅、鉛)污染和有機(jī)酚污染，在枯水季節(jié)水質(zhì)較差，最大主要污染在鄱陽湖的南面，來自南昌的生活和工業(yè)污水。饒何上游是中國最大的銅礦基地，由饒河帶進(jìn)的主要是重金屬銅污染。污染最輕微的地區(qū)是鄱陽湖的西北面，也就是鄱陽湖保護(hù)區(qū)所在地。鄱陽湖是大型的淺水湖泊，湖面大部分在海拔12?7米之間，最深點(diǎn)海拔7.5米，差不多位于湖的最南端。湖床的形成起因于泥沙的淤積。
保護(hù)區(qū)內(nèi)植物分布受到全年水位大幅升降變動(dòng)的重大影響，導(dǎo)致一些親緣接近的植物群落環(huán)湖分布并隨著高度逐漸改變。1985年12月至1986年元月，吳英豪、戴惠平、黃祖友三人對鄱陽湖保護(hù)區(qū)的植被進(jìn)行過簡單的調(diào)查，鑒定出保護(hù)區(qū)內(nèi)16個(gè)群叢和區(qū)鄰近地點(diǎn)另三個(gè)群叢(將來進(jìn)一步的研究，可能會(huì)把部分獨(dú)立的群叢劃歸同類)，簡述如下。
1、水生植被
（1）馬來眼子菜－苦草群叢
分布于各湖池水域深處。主要以馬來眼子菜、苦草生物量最高。常見的還有黑藻、大茨藻、小茨藻(Naias minor Rll.)、--菜、菹菜、金魚藻等。本群叢面積最大，生物量高。尤其是馬來眼子菜，它的塊莖是珍禽白鶴和天鵝的主要餌料。
（2）牛毛氈群叢
本群叢基本上由牛毛氈組成，介入值物除了極少量的水蓼和馬來眼子菜外，并無其它植物介入，分布在梅西湖等處。
（3）荻－苔草，馬來眼子菜群叢
本群叢見于蚌湖湖灘與水際文匯處，面積不大，介入植物有水蓼等。其中荻呈片狀分布，占主要成份。在荻未占領(lǐng)的區(qū)域由苔草和馬來眼子菜稀疏覆蓋。
2、草洲植被
草洲植被主要是指生長在湖灘上除水生植物外的陸生、濕生植物的構(gòu)成。草洲植被的面積嚴(yán)重地受湖水水位控制。汛期，湖面擴(kuò)大，使得大部分草洲植物縮短了生長期，即必須在汛期前完成生長，水淹后進(jìn)入休眠狀態(tài)。在秋天汛期結(jié)束后，不少植物為了積聚有機(jī)物，在冬天并不落葉，如蛇含委陵菜等。
葦叢植被，主要包含苔草、蘆葦、紫云英、水田碎米薺等。
（1）苔草群叢
叢主要分布在大湖池、大汊湖、梅西湖等離湖水有較遠(yuǎn)距離的區(qū)域。以苔草占主要地位，有委陵菜、藜蒿等植物介人。
（2）苔草，水田碎米薺、藜蒿－荸薺群叢
叢主要分布在大湖池近湖100?000米的部分地域。組成植物除苔草、水田碎米薺、藜蒿和剛毛荸薺外，滲入的植物還有水蓼、野艾蒿等。
（3）苔草，水蓼群叢
叢面積較小，分布在梅西湖湖灘的中間地段，除苔草和水蓼外，很少有其它植物介入。
（4）苔草，藜篙－蘆葦群叢
叢分布在沙湖南面。面積約1平方公里以上。
（5）蘆葦，季陵菜群叢
叢分布面積比較廣，大湖池西南、南緣，沙湖南緣及令公洲均有。以蘆葦為主要種，多為人工栽培，在梅西湖地區(qū)沙山邊也有生長。
（6）狗牙根，破銅錢，紫云英群叢
叢常見于河岸、湖緣及路邊，尤以常湖池和象湖為多。滲入植物有少量藜蒿、野艾蒿、馬蘭和水田碎米薺。
（7）委陵菜群叢
叢面積極小，分布在沙湖東南。
（8）苔草，剛毛荸薺群叢
叢面積較小，分布在象湖，介入植物有水蓼等。
（9）苔草，剛毛荸薺－野義蒿群叢
叢分布在梅西湖西緣，由苔草、剛毛荸薺、野艾蒿組成。范圍內(nèi)有若干小塘池，池內(nèi)行有荇菜、剛毛荸薺、水蓼、輪生狐尾藻和苔草等。
（10）苔草，藜蒿，蛇含委陵菜，紫云英群叢
叢分布在蚌湖，面積比較大，組成植物也較固定。有苔草、藜蒿、蛇含委陵菜、紫云英等植物組成。
（11）苔草，蛇含委陵菜，紫云英群叢
叢也見于蚌湖。在本群叢內(nèi)圍，組成植物以苔草為主，蛇含委陵菜、紫云英為副。由于土壤肥沃，各種植物生長旺盛，競爭激烈，以苔草占優(yōu)勢。
（12）肉根毛茛，水田碎米薺，水蓼群叢
叢分布比較廣，在中湖池、常湖池、大汊湖等有分布。其中在中湖池分布較勻，在常湖池水田碎米薺較少。肉根毛茛有時(shí)迅速地先于其他植物從才退出的湖灘上萌出，開花結(jié)果，會(huì)至在較淺水中萌出。在大汊湖，介入本群叢的還可見南亞稷、馬蘭、結(jié)縷草、水田碎米薺等。
（13）苔草－董菜，委陵菜，野艾蒿－紫云英群叢
叢主要分布在中湖池外緣。
除以上群叢外，還可以區(qū)分出(17)蛇含委陵菜，紫云英群叢和(18)酢漿草，薺菜，豬殃殃群叢等。
（14）沙生植被
只分布于吳城鎮(zhèn)東北的吉山的沙質(zhì)地帶。
沙生植被的構(gòu)造簡單，其中以馬鞭草科的落葉灌木，單葉蔓荊子為主，它能在沙地上利用匍匐莖向前伸展，同時(shí)各莖節(jié)還能生根扎入沙中，屬于一種良好的固沙灌木。它的黑色球果入藥，能治神經(jīng)性頭痛，風(fēng)濕骨痛和感冒等。
（15）單葉蔓荊子，茵陳蒿，苔草群叢
叢分布在梅西湖附近的吉山沙區(qū)，介入植物有結(jié)縷草、白茅、羊蹄、胡枝子、一年蓬等。吉山一帶曾為林區(qū)，在19世紀(jì)60年代，大部分林木被砍伐。在抗戰(zhàn)期間也有伐林，最后一片林區(qū)在1958年砍盡。
3、保護(hù)區(qū)內(nèi)主要的植物由禾本科，莎草科，眼子菜科，菊科，蓼科，水鱉科組成。據(jù)考察，鄱陽湖有102種水生維管束植物(附錄1)，其中大部分(可能全部)部分布于保護(hù)區(qū)內(nèi)。
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